Nad bezpieczeństwem dokumentów finansowych prezentowanych na portalu Moje Rachunki online czuwa system zabezpieczeń. Należy do nich zaliczyć: - Użycie szyfrowania SSL - komunikacja pomiędzy Twoim komputerem, a systemem jest szyfrowana - Użycie bezpiecznego podpisu elektronicznego - wszystkie dokumenty są podpisane, a każda zmiana w dokumencie jest rozpoznawalna -  Wszystkie dane w systemie przechowywane są w bezpiecznym archiwum. Kopia wszystkich dokumentów znajduje się w drugim niezależnym Data Center. - Wszystkie transakcje bezgotówkowe przeprowadzone na portalu objęte są gwarancjami bankowymi.